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マイクロバイオーム標品（Microbiome Standard）

ATCC^® マイクロバイオーム標品概要

ヒト腸内細菌叢（腸内フローラ）や環境微生物叢等のマイクロバイオーム研究において、メタゲノム解析により豊富で有用な情報を入手できるようになりました。しかし、現在広く使用されているプロトコル（ゲノムDNA抽出、PCRによるゲノム増幅、シークエンス及びデータ解析等）は複雑で、各ステップでバイアスが掛かる事が想定されます。

このため、アッセイ標準化（最適化）が重要な課題となっています。なぜなら、これらのバイアスにより微生物コミュニティーの”真”の構成比率が不透明となるために、データの不正確性や誤った結論を導き出される可能性があるからです。

ATCCでは当研究分野におけるプロトコル標準化（最適化）をサポートすべく、菌株及び抽出DNAゲノムを混合したマイクロバイオーム標品（mock community）の分譲を開始しました。

これらの標品はアッセイのばらつきを抑え、有益な比較データを提供し、メタゲノム解析のワークフローやマイクロバイオーム研究のプロトコル標準化（最適化）を可能にします。また、プロトコル検討時にご使用頂く事で、潜在するバイアスを検出し、サンプルから得られる微生物コミュニティープロファイルのアッセイ変動を除去することが可能です。

さらにATCCでは、One Codex社と共同で開発した解析ツールもご提供してます。このツールは標品を用いた際の解析が簡便に行えるよう開発されており、16S rRNA遺伝子解析データ及びショットガンシークエンスデータに対応しています。